准格尔盆地的地形真的很有辨识度，整体轮廓是个不规则的三角形，东西长700多公里，南北最宽处有450公里，面积大概38万平方公里，是我国第二大内陆盆地。
它不像很多内陆盆地那样完全封闭，西侧的山地有好几个缺口，额尔齐斯河就是从这里流出国境的，半开放的地形让大西洋的水汽能飘进来不少。盆地地势整体向西倾斜，海拔从东部的1000米左右降到西部的不到200米，里面不是一马平川，而是交错分布着草原、沙漠和盐湖，古尔班通古特沙漠就占了盆地近三分之一的面积。