婚外胚胎案伪造证件为何只拘留公安机关认定二人的行为属于“伪造、使用国家机关证件”的行政违法行为。由于该假证仅用于私人领域的胚胎操作，未用于诈骗、贷款等其他严重犯罪，社会危害性相对有限，因此首先按行政违法处理 。

根据《刑法》规定，“伪造、变造、买卖国家机关证件罪”通常需要“情节严重”或“造成严重后果”才触发刑事立案 。在本案中，由于胚胎尚未移植，未对原配朱女士造成如“婚外生育子女”这类不可逆的实质性损害后果，因此公安机关认为尚未达到刑事追诉的标准 。

总而言之，5日行政拘留是公安机关基于当前证据和损害后果作出的阶段性处理。案件最终的法律责任认定，还需等待检察机关的审查结果以及后续民事诉讼的判决。