最早冲突爆发于1904至1905年日俄战争，两国为争夺中国东北、朝鲜半岛以及库页岛控制权开战，最终日本取胜，割占库页岛南部，获得远东大量权益，埋下对立种子。

二战时期冲突再度激化，1945年苏联对日宣战，迅速击溃盘踞我国东北的关东军，顺势收复库页岛南部，占领南千岛群岛（日本称北方四岛）。日本战败投降后，苏联牢牢掌控这片群岛，领土争端正式定型。

战后数十年，日本始终要求归还四岛，俄方坚持领土归属已定，拒绝妥协。加之历史认知、美日同盟等外部因素叠加，两国始终未签订和平条约。除此之外，两国渔业海域纠纷、远东资源开发分歧持续存在。

百年冲突核心绕不开领土博弈，美国扶持日本扩军又进一步加剧双方对立，这片远东海域的历史矛盾短期内很难彻底消解。