公司能用自然人代开的发票入账吗?当然可以。不过要注意以下问题：
一、不要用公司自己的法人、财务、员工的身份来代开货物和劳务类发票，否则查到关联会被怀疑虚列成本。除此以外，租赁类和资产类可以，例如法人把自己的房子车辆租给公司。
二、根据法律，个体户也属于自然人，不要找个体户乱开咨询费、信息费、广告费、服务费。很多企业利用个体户的这类票来抵扣、充成本，殊不知税务局产生疑问会调查这些项目对应业务的真实性。例如咨询费，咨询了什么，提供者的资质，咨询的过程，结果评估等，都得有白纸黑字证据，否则光是一张发票，会被怀疑虚开发票。
三、一定要代扣代缴个税。有的公司拿到自然人开具的劳务报酬发票，不申报代扣代缴个税，几年后被税务局查到，因为累计人次多时间长，未申报缴税金额已是天文数字，再加罚款滞纳金，直接损失惨重