分为三个阶段的南明战争。第一阶段：南明弘光朝廷执行联清灭闯政策。主动把大部分真空的山东、河南地区送给清军（李自成同时八个月丢失占据的现有华北地区）。南明文官集团忙于党争甚至内战（左良玉公然反叛挑动内乱）。清军击败李自成后，趁南明内乱率领满蒙八旗主力迅速南下。南明文官集团和军阀、地头蛇势力主导的南明军队迅速瓦解败亡。南明弘光朝廷和隆武朝廷也迅速灭亡，南明丧失了大部分财税重地。
第二阶段：清廷自以为已经平定天下（明廷两京、大部分财税重地、重点军事要塞均落入清军手中），推行全国性剃发易服。却造成全国南北男女老幼起